Helicobacter ინფექცია იწვევს ანთებით და იმუნურ რეაქციებს, უჯრედული დეგენერაცია, ნეკროზი და ანთებითი უჯრედის ინფილტრაცია, რომელიც ჩანს მის ინფიცირებულ კუჭის ლორწოვან გარსში, ხოლო შრატში შეიძლება გამოვლინდეს სპეციფიური ანტისხეულები.Helicobacter ასოცირდება სხვადასხვა დაავადებებთან, როგორიცაა გასტრიტი, პეპტიური წყლული, კუჭის კიბო, კუჭის ლორწოვანთან ასოცირებული ლიმფოიდური ქსოვილის ლიმფომა (MALT ლიმფომა), არასტეროიდული ანთების საწინააღმდეგო ასოცირებული გასტროპათია ფუნქციური დისპეფსია და GERD.